Træerne
Blykobbe Plantage består af en blanding af løv- og nåletræer, omtrent halvt af hver. Fordi plantagen er anlagt på gamle sandflugtsarealer, er jorden, især ud mod havet, meget sandet. Den vestlige rand af plantagen er udlagt som urørt skov, og her vokser skovfyr, der blev plantet i 1800tallet.
I den sydlige del af plantagen er jordbunden næringsfattig. Her vokser birk og forskellige nåletræer som skovfyr og sitkagran. Nogle steder vokser også de i danske forhold lidt usædvanlige contortafyr og weymouthfyr. I den nordlige ende af plantagen ved Birke Allé, hvor den frodige jordbund findes, vokser der bøg og eg. Ved Blykobbe Å findes et område med ask og rødel.
De steder, hvor træarterne står i den ”forkerte” jord for den art, er væksten lav og træerne mistrives. Det gælder for eksempel bøgene mellem Rævehøj og havet.
Plantagen drives naturnært og har i mange år udelukkende været forynget ved hjælp af træernes egen frøsætning.